小便和射精疼痛一般考虑是尿路感染或者前列腺炎的可能性。小便疼痛通常可能是由于泌尿系感染的原因造成的，射精疼痛则通常可能是慢性前列腺炎引起的。患者可以通过常规检查，来判断疾病的具体类型以及严重程度，以便对症下药。

1、对于尿路感染，绝大多数都是因为细菌顺着尿道逆行而引起感染的。除了尿痛之外，还可能会出现尿频、尿急、尿分叉的情况。首先需要多喝水，勤排尿，从而减少细菌在尿路中滞留和繁殖。同时，患者可以服用尿感宁颗粒、三金片、热淋清等中成药。尿感宁颗粒具有清热解毒、通淋利尿，往往用于膀胱湿热所致的病症，用于各种急慢性的尿路感染；三金片是清热剂，具有清热解毒利湿、通淋益肾的功效；热淋清主要是清热解毒、利尿通利，也可用于急慢性的尿路感染。

2、对于前列腺炎，慢性前腺炎好发于性活跃期的青年男性患者。目前可以治疗前列腺炎的中成药较多，如前列解毒、前列安栓、前列舒通等。患者需要根据症状形式来选择用药，看是属于血瘀、湿热还是肾虚。如果是血瘀，就采用前列解毒这种活血化瘀的中成药，效果比较好。如果是湿热，可以采用前列舒通、前列欣这种有清热利湿效果的药。如果是肾虚，就要用知柏地黄丸、六味地黄丸、金匮肾气丸等补肾的药。

综上，患者需要在明确病症的情况下对症下药。此外，患者在治疗期间注意多喝水，尽量不要同房或减少同房，适当休养生息，不要喝酒，不要吃辛辣、刺激类食物，这样有利于症状的早日痊愈，否则有可能会造成症状的反复发作和治疗周期的延长。