包皮过长会发臭可能与包皮垢过多有关，也可能是包皮龟头炎、尿道炎等原因所引起，应当对包皮内部进行清洗，当存在感染时，应使用抗感染药物进行治疗。

1、包皮垢过多：由于存在包皮过长，不经常对包皮内部进行清洗，包皮内部容易生成包皮垢，就会使局部出现异味，但是没有其他异常表现，应当对包皮内部进行清洗，将包皮垢清洗干净，防止出现感染。

2、包皮龟头炎：包皮垢长期存在，可能会诱发真菌或细菌性龟头炎，就会导致局部有异味，可能还伴有瘙痒，刺痛等症状，确诊后，可应用克霉唑软膏、红霉素软膏等药物进行针对性治疗。

3、尿道炎：也是由于病菌感染引起的，症状严重时，会导致整个阴茎出现异味。而这种情况下，包皮过长未及时清理也会发臭。

此外，也有可能由其他因素引起，如阴茎癌。建议及时前往正规医院就诊治疗。在治疗期间，应当做好日常护理，注意下体卫生，并且要谨遵医嘱，合理用药，争取早日康复。